Geschreven door de WUR

Opsporen van onbekende afweersystemen

Van veel bacteriële immuunsystemen weten we niet hoe ze werken. Het ERC onderzoek van Swarts richt zich op het uitzoeken hoe deze immuunsystemen werken, en om te bepalen of we ze kunnen gebruiken als nieuwe genetische tools. Deze tools kunnen misschien nog beter virussen herkennen, of nog efficiënter veranderingen in DNA aanbrengen. In de afgelopen jaren heeft Swarts al verschillende immuunsystemen onderzocht. Een van deze systemen, CRISPR-Cas12a, wordt momenteel gebruikt om COVID-19 te detecteren.

Chemische taal ontcijferen

Marnix gaat in zijn ERC-project met zijn team nieuwe bioinformatica-methoden ontwikkelen om de chemische taal van het microbioom in kaart te brengen en haar betekenis te ontrafelen. Hiervoor maken we gebruik van diverse data: DNA-informatie van de microben waarin we metabole genclusters kunnen detecteren voor de aanmaak van belangrijke moleculen, de patronen waarop deze genen aan en uit gezet worden, en informatie over de chemische structuren van de moleculen zelf.

Op basis hiervan zal het team nieuwe algoritmes ontwikkelen om te voorspellen hoe de moleculen er uit zien en wat voor rol ze hebben in de interacties tussen bacteriën en met de planten en mensen waarmee deze bacteriën leven. Uiteindelijk zal dit het mogelijk maken om microbiomen doelgericht te herontwerpen om daarmee gewassen te beschermen tegen ziekte en droogte, en in de mens bijvoorbeeld metabole ziekten te kunnen behandelen.

Lees hier het volledige artikel op de website van wur.nl

Door: RTV Rijnstreek - Redactie